Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms