Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P20040 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P20040 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P20040 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P20040 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P20040 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P20040 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P20040 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P20040 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P20040 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P20040 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P20040 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P20040 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P20040 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P20040 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P20040 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P20040 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P20040 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P20040 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P20040 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P20040 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P20040 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P20040 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P20040 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P20040 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P20040 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P20040 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P20040 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P20040 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P20040 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P20040 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P20040 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P20040 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P20040 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P20040 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P20040 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P20040 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P20040 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P20040 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P20040 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P20040 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P20040 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P20040 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P20040 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P20040 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P20040 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P20040 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P20040 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P20040 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P20040 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P20040 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P20040 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P20040 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P20040 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P20040 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P20040 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P20040 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P20040 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P20040 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P20040 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P20040 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P20040 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P20040 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P20040 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P20040 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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P20040 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P20040 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P20040 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P20040 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P20040 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P20040 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P20040 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms