Protein–RNA interactions for Protein: P15620

Znf271, Zinc finger protein 271, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf271P15620 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf271P15620 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf271P15620 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf271P15620 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf271P15620 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf271P15620 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf271P15620 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Znf271P15620 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf271P15620 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf271P15620 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf271P15620 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf271P15620 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf271P15620 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms