Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RhoP15409 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RhoP15409 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RhoP15409 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RhoP15409 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RhoP15409 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RhoP15409 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RhoP15409 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
RhoP15409 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
RhoP15409 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RhoP15409 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
RhoP15409 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
RhoP15409 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
RhoP15409 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
RhoP15409 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RhoP15409 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
RhoP15409 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
RhoP15409 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RhoP15409 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
RhoP15409 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
RhoP15409 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RhoP15409 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RhoP15409 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RhoP15409 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
RhoP15409 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RhoP15409 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RhoP15409 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RhoP15409 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
RhoP15409 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RhoP15409 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RhoP15409 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RhoP15409 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RhoP15409 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RhoP15409 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RhoP15409 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RhoP15409 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RhoP15409 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RhoP15409 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RhoP15409 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RhoP15409 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RhoP15409 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RhoP15409 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RhoP15409 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
RhoP15409 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RhoP15409 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RhoP15409 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
RhoP15409 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
RhoP15409 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RhoP15409 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RhoP15409 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
RhoP15409 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RhoP15409 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RhoP15409 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RhoP15409 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RhoP15409 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RhoP15409 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RhoP15409 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RhoP15409 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RhoP15409 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RhoP15409 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RhoP15409 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
RhoP15409 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhoP15409 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhoP15409 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhoP15409 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhoP15409 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhoP15409 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhoP15409 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhoP15409 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhoP15409 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhoP15409 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhoP15409 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhoP15409 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhoP15409 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhoP15409 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhoP15409 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhoP15409 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhoP15409 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhoP15409 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
RhoP15409 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhoP15409 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhoP15409 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhoP15409 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhoP15409 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
RhoP15409 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhoP15409 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
RhoP15409 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhoP15409 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhoP15409 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhoP15409 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhoP15409 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhoP15409 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhoP15409 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhoP15409 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhoP15409 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhoP15409 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhoP15409 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhoP15409 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhoP15409 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhoP15409 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms