Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cxcl2P10889 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cxcl2P10889 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cxcl2P10889 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cxcl2P10889 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cxcl2P10889 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cxcl2P10889 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cxcl2P10889 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cxcl2P10889 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cxcl2P10889 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cxcl2P10889 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms