Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm5392-201ENSMUST00000122189 789 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm11266-201ENSMUST00000139835 1271 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Crem-229ENSMUST00000151084 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Itgb1bp1-202ENSMUST00000172834 801 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm6113-201ENSMUST00000180319 639 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm3489-201ENSMUST00000190083 528 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm37724-201ENSMUST00000195240 1221 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm18330-201ENSMUST00000199246 547 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm43893-201ENSMUST00000203362 437 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm15394-201ENSMUST00000119656 1308 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm13674-201ENSMUST00000121276 823 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm8356-202ENSMUST00000164917 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 AC165245.1-201ENSMUST00000214181 636 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Csn2-201ENSMUST00000082370 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm4224-201ENSMUST00000211557 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms