Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PtprqP0C5E4 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms