Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-Eb1P04230 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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