Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms