Protein–RNA interactions for Protein: O54907

Tnfsf12, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 12, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf12O54907 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfsf12O54907 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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