Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TsksO54887 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TsksO54887 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TsksO54887 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TsksO54887 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TsksO54887 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TsksO54887 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TsksO54887 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TsksO54887 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TsksO54887 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TsksO54887 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TsksO54887 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TsksO54887 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TsksO54887 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TsksO54887 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TsksO54887 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TsksO54887 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TsksO54887 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TsksO54887 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TsksO54887 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TsksO54887 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TsksO54887 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TsksO54887 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TsksO54887 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TsksO54887 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TsksO54887 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TsksO54887 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TsksO54887 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TsksO54887 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TsksO54887 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TsksO54887 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TsksO54887 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TsksO54887 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TsksO54887 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TsksO54887 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TsksO54887 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TsksO54887 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TsksO54887 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TsksO54887 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TsksO54887 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TsksO54887 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TsksO54887 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TsksO54887 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TsksO54887 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TsksO54887 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TsksO54887 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TsksO54887 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TsksO54887 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TsksO54887 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TsksO54887 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TsksO54887 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TsksO54887 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TsksO54887 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TsksO54887 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TsksO54887 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TsksO54887 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TsksO54887 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TsksO54887 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TsksO54887 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TsksO54887 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TsksO54887 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TsksO54887 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TsksO54887 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TsksO54887 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TsksO54887 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TsksO54887 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TsksO54887 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TsksO54887 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TsksO54887 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TsksO54887 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TsksO54887 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TsksO54887 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TsksO54887 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TsksO54887 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TsksO54887 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TsksO54887 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TsksO54887 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TsksO54887 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TsksO54887 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TsksO54887 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TsksO54887 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TsksO54887 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TsksO54887 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TsksO54887 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TsksO54887 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TsksO54887 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TsksO54887 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TsksO54887 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TsksO54887 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TsksO54887 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TsksO54887 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TsksO54887 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TsksO54887 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TsksO54887 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TsksO54887 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TsksO54887 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TsksO54887 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TsksO54887 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TsksO54887 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TsksO54887 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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