Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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