Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Gm44706-201ENSMUST00000206822 815 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Gm18510-201ENSMUST00000219335 1096 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 AC153152.2-201ENSMUST00000223165 959 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Tas2r107-201ENSMUST00000065781 1032 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Reg1-201ENSMUST00000079926 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Gm38104-201ENSMUST00000195121 1895 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Gm37258-201ENSMUST00000191734 1627 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Gm45210-201ENSMUST00000206401 1577 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Gm15624-201ENSMUST00000145420 1405 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Zfp967-201ENSMUST00000108997 417 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Zfp969-201ENSMUST00000109027 417 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Zfp965-203ENSMUST00000109043 417 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Gm11278-201ENSMUST00000121002 997 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Gm12096-201ENSMUST00000121149 829 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Gm14800-201ENSMUST00000122084 1272 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Gm16363-201ENSMUST00000132460 877 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Gm16589-201ENSMUST00000159522 918 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Vmn1r-ps31-201ENSMUST00000174112 238 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Gm26706-201ENSMUST00000180718 746 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Gm43531-201ENSMUST00000200676 1114 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Gm43748-201ENSMUST00000202329 1233 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Gm43954-201ENSMUST00000204634 544 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Gm45145-203ENSMUST00000208872 958 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 AC164087.1-201ENSMUST00000215174 733 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lhx8O35652 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms