Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atf6bO35451 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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