Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Kcns1O35173 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms