Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C4

Gm4340, Predicted gene 4340, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4340L7N2C4 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4340L7N2C4 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms