Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20878L7N244 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 2579 ms