Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vwa3bJ9JI28 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vwa3bJ9JI28 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vwa3bJ9JI28 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vwa3bJ9JI28 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vwa3bJ9JI28 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vwa3bJ9JI28 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vwa3bJ9JI28 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vwa3bJ9JI28 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vwa3bJ9JI28 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vwa3bJ9JI28 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vwa3bJ9JI28 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vwa3bJ9JI28 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vwa3bJ9JI28 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vwa3bJ9JI28 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vwa3bJ9JI28 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vwa3bJ9JI28 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vwa3bJ9JI28 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vwa3bJ9JI28 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vwa3bJ9JI28 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vwa3bJ9JI28 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vwa3bJ9JI28 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vwa3bJ9JI28 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vwa3bJ9JI28 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vwa3bJ9JI28 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vwa3bJ9JI28 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vwa3bJ9JI28 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vwa3bJ9JI28 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vwa3bJ9JI28 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vwa3bJ9JI28 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vwa3bJ9JI28 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vwa3bJ9JI28 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vwa3bJ9JI28 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vwa3bJ9JI28 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vwa3bJ9JI28 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vwa3bJ9JI28 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vwa3bJ9JI28 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Vwa3bJ9JI28 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vwa3bJ9JI28 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vwa3bJ9JI28 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vwa3bJ9JI28 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vwa3bJ9JI28 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vwa3bJ9JI28 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vwa3bJ9JI28 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vwa3bJ9JI28 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vwa3bJ9JI28 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vwa3bJ9JI28 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vwa3bJ9JI28 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vwa3bJ9JI28 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vwa3bJ9JI28 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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