Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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