Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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