Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms