Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm18552-201ENSMUST00000187425 538 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm12248-203ENSMUST00000219877 1160 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 1810059H22Rik-207ENSMUST00000204809 289 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
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