Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm3371F7CQW8 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms