Protein–RNA interactions for Protein: F6ZIS7

Rarres1, Retinoic acid receptor responder (tazarotene-induced) 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rarres1F6ZIS7 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rarres1F6ZIS7 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rarres1F6ZIS7 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rarres1F6ZIS7 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rarres1F6ZIS7 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rarres1F6ZIS7 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rarres1F6ZIS7 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rarres1F6ZIS7 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rarres1F6ZIS7 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rarres1F6ZIS7 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rarres1F6ZIS7 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rarres1F6ZIS7 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rarres1F6ZIS7 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rarres1F6ZIS7 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rarres1F6ZIS7 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rarres1F6ZIS7 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rarres1F6ZIS7 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rarres1F6ZIS7 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Rarres1F6ZIS7 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Rarres1F6ZIS7 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Rarres1F6ZIS7 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rarres1F6ZIS7 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.3 ms