Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Myo5cE9Q1F5 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Myo5cE9Q1F5 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms