Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.03■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms