Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC7.77□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC7.77□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms