Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cttnbp2B9EJA2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms