Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Phf11bB4XVQ1 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Phf11bB4XVQ1 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Phf11bB4XVQ1 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Phf11bB4XVQ1 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms