Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Prrt4B2RU40 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms