Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rrn3B2RS91 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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