Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Uhrf1bp1B2KF50 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.6 ms