Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2012B1B0R1 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms