Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Tmem63a-201ENSMUST00000027800 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Itga7-202ENSMUST00000218290 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Ilf3-201ENSMUST00000067646 3549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Tmem184b-205ENSMUST00000228002 3315 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Traf1-207ENSMUST00000172159 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Gm37593-201ENSMUST00000191669 3254 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Fam161b-202ENSMUST00000065536 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Prkcd-208ENSMUST00000112211 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Ttk-202ENSMUST00000185913 2731 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Mmp9-201ENSMUST00000017881 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Tmem238A9JSM3 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms