Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Atp8b5A3FIN4 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Atp8b5A3FIN4 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Atp8b5A3FIN4 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Atp8b5A3FIN4 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Atp8b5A3FIN4 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Atp8b5A3FIN4 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Atp8b5A3FIN4 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Atp8b5A3FIN4 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Atp8b5A3FIN4 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Atp8b5A3FIN4 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Atp8b5A3FIN4 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Atp8b5A3FIN4 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Atp8b5A3FIN4 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Atp8b5A3FIN4 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Atp8b5A3FIN4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp8b5A3FIN4 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Atp8b5A3FIN4 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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