Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn3aA2ASI5 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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Scn3aA2ASI5 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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