Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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PtprfA2A8L5 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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PtprfA2A8L5 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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