Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Top3bQ9Z321 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Top3bQ9Z321 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Top3bQ9Z321 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Top3bQ9Z321 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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