Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mbd3Q9Z2D8 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms