Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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RfxankQ9Z205 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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RfxankQ9Z205 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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RfxankQ9Z205 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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RfxankQ9Z205 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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RfxankQ9Z205 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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RfxankQ9Z205 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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RfxankQ9Z205 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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RfxankQ9Z205 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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RfxankQ9Z205 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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RfxankQ9Z205 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RfxankQ9Z205 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RfxankQ9Z205 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms