Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip6Q9Z1Y4 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms