Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Lgr5Q9Z1P4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lgr5Q9Z1P4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Lgr5Q9Z1P4 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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