Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nek4Q9Z1J2 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms