Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Cldn9Q9Z0S7 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Cldn9Q9Z0S7 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn9Q9Z0S7 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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