Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Apobec2Q9WV35 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms