Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Pfdn5Q9WU28 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Pfdn5Q9WU28 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Pfdn5Q9WU28 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Pfdn5Q9WU28 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Pfdn5Q9WU28 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Pfdn5Q9WU28 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Pfdn5Q9WU28 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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