Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gpc6Q9R087 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gpc6Q9R087 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gpc6Q9R087 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gpc6Q9R087 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gpc6Q9R087 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gpc6Q9R087 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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