Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf4Q9QZS2 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms