Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnt3Q9QZ47 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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