Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PolkQ9QUG2 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms